2004年9月，同济大学通过公开招聘，聘任美籍华人学者杨杰为生命科学与技术学院院长、教授。

    2006年3月21日,由于杨杰在学科建设、行政管理和队伍建设方面不适合担任院长等行政职务，学校正式免去其院长等职务。在此前，学校已经收到反映杨杰在有关申报材料。

　　中涉嫌学术造假的举报，考虑到问题的严肃性和复杂性，本着实事求是、公正和对人负责的原则，学校开始着手调查。现经查实，杨杰在同济大学工作期间，存在学术造假行为，涉及事实如下：

　　一、2005年3月，在有关博士点的申报材料中，一篇2004年发表于《肺癌》(LungCancer)杂志的论文被列入杨杰作为第一作者的论文清单。经查证，该论文并非杨杰的成果。文献检索所显示的“J. Y ang”，不是“Jie Y ang”，而是“JunYang”。杨杰在《肺癌》杂志刊出的论文是在填写申报材料之后，而且杨杰是第二作者。

　　二、2005年7月，杨杰在申报长江学者特聘教授候选人的申请材料中，再一次将 J u n Y a n g 在《L u n g C a n c e r》上发表的论文列入自己的成果清单。

　　三、2006年3月，杨杰在申报国家自然科学基金重点和面上项目的材料中，将他人承担的国家“十五”攻关项目子课题(课题编号2004BA719A0402)列入其承担的科研项目栏目。

　　同济大学方面表示，杨杰的行为背离了一个教育工作者和学者基本的科学精神和诚信操守，违反了学校和教育部《关于加强学术道德建设的若干意见》等规章制度，根据同济大学与其签订的聘任合同的有关条款，昨天，学校决定终止与杨杰的聘用合同，同时解除其同济大学教授任职职务的聘任。